Перед вами продолжение знаменитой истории Ямато 2199. Те события рассказывали о печальных для человечества временах. Земля была полностью уничтожена. Планета покрылась ядовитыми радиационными отходами, которые не позволили людям продолжать спокойную жизнь. Под землей жить тоже невозможно. Люди, спрятавшиеся в укрытиях, протянут не больше года. Выступить с войной против захватчиков нереально,ведь силы неравные. Однако слухи вселяют в сердца спасшихся надежду. Говорят, что существует военный корабль, способный победить агрессоров! На его поиски и отправились главные герои. Мы же узнаем историю космического линкора Ямато в 2202 году.