Отправляемся на просторы космоса после того, как прогремела знаменита война империй Белой Кометы. Три года прошло с момента окончания огня. "Ямато" по-прежнему находится под управлением коллектива, который возглавляется капитаном Кодаем. Главные действующие лица повествования опытны и очень умны. Их изобретательности хватает, чтобы при нехватке ресурсов продолжать действовать уверенно и успешно. Кто бы мог подумать, что вскоре им предстоит столкнуться с настолько опасным соперником, что в ходе сражения предстоит применять все свои накопленные ресурсы. Что же будет дальше?